Коклюш особенно тяжело протекает у детей первых месяцев жизни - с приступами апноэ, пневмонией, ателектазами (25%), судорогами (3%), энцефалопатией (1%). Прививка от коклюша, проведенная детям в охвате выше 95% в России привел к снижению заболеваемости с 19,06 на 100 000 населения и 91,46 на 100 000 детей до 14 лет в 1998 г. до 3,24 и 18,86 в 2005 г. и 5,66 в 34,86 в 2007 г. соответственно.