Каждый первичный липопротеин характеризуется наличием в его составе индивидуального, только ему присущего белка (аполипопротеина). Аполипопротеины обозначают латинскими буквами, причём некоторые из них представляют семейство белков и обозначаются дополнительно ещё и цифрами (например, апо-А1, апо-А2 и т.д.).