Клиническая диагностика достоверна лишь при крупозной пневмонии, однако вероятность пневмококковой этиологии внебольничной пневмонии, отита, синусита составляет 60-80°о. Верифицировать диагноз можно только на основании результатов микробиологического исследования соответствующего биосубстрата: при рините - отделяемого носовых ходов (мазок), при отите, синусите - гнойного экссудата, при пневмонии - мокроты, при менингите - спинно-мозговой жидкости.