Аллоиммунная, или изоиммунная, нейтропения новорождённых возникает у плода вследствие антигенной несовместимости нейтрофилов плода и матери. Изоантитела матери относятся к классу IgG, они проникают через плацентарный барьер и разрушают нейтрофилы ребёнка. Изоантитела - обычно лейкоагглютинины, они реагируют с клетками больного и его отца, не реагируют с клетками матери.